Tuksnešos ir dažādas sēnes. Dažas tuksneša sēnīšu kolonijas var dzīvot miljoniem gadu, pagarinot attīstības procesu. Citi rada simbiotiskas attiecības ar citiem organismiem, lai nodrošinātu izdzīvošanu. Tuksneša sēnes var gulēt neaktivizētas tuksneša augsnē, līdz tās tiek traucētas, pēc tam uzbrukt ar toksiskām sporām, kas izraisa nopietnas slimības. Daži tuksneša sēnīšu veidi var nokrāsot tuksneša audeklus ar spilgtas krāsas tapetēm.
Tuksnešos dzīvo dažādu veidu sēnes.Ķērpji
Ķērpji, kas pazīstami kā "pionieru augi", ir niecīgi organismi, kas var izturēt nelīdzenu, karstu un aukstu vidi un sausumu. Ķērpju ķermeni jeb tallu veido aļģes un sēnītes, kas kopā aug simbiotiskās attiecībās. Aļģu šūnas nodrošina barības vielas sēnītei, un sēne pasargā aļģes no atmosfēras apstākļiem.
Ķērpji var augt uz neparastām virsmām, piemēram, smiltīm, klintīm, augsnes, dzīvnieku kauliem un sarūsējuša metāla. Ķērpji aug dažādās krāsās, piemēram, sarkanā, oranžā, dzeltenā, zaļā un brūnā toņos. Uz viena laukakmens var izaugt vairāk nekā duci sēņu sugu.
Ir zināmas apmēram 15 000 ķērpju sugas. Atsevišķi ķērpji, piemēram, garozas ķērpji (garozai līdzīga sēnīte), lēna augšanas līmeņa dēļ var dzīvot simtiem vai tūkstošiem gadu. Krustozes ķērpji var veidoties uz klintīm. Atsevišķi ķērpji ir apdraudēti, jo piesārņots gaiss un lietus ūdens var iznīcināt aļģu šūnas, nogalinot sēnīšu partneri.
Mikorizas
Mikorizāzes ir sēnīšu augu sistēmas, kas veido simbiotiskas attiecības ar augu saknēm. Saknes nodrošina nepieciešamās barības vielas un vietu sēnītēm, lai piestiprinātu pavedienus. Sēnītes aizsargā augu no tādiem uzbrukumiem kā patogēni, un to pavedieni darbojas kā sakņu sistēma, lai palīdzētu augam saņemt papildu ūdeni un barības vielas. Kad attiecības ir izveidojušās, augs var būt atkarīgs no Mycorrhizae, kad tā barības vielas tiek pārtrauktas.
Mikorizijas tiek iedalītas divos veidos - ektomikorizijas un endomicorizijas. Ektomikoreizijas veido apvalku ap auga saknēm. Pārklājums izaudzē hyfae (sēnītes ķermeņa pavedienveidīgās sastāvdaļas) saknēs, pēc tam augsnē. Endomicorizu pavedieni aug šūnās un pēc tam augsnē. Sēne uzlabo izturību pret sausumu, imunitāti pret slimībām un barības vielu uzņemšanu saimniekaugam.
Sēnes
Podaxis vai tuksneša pinkains krēpes ir atrodams Sonoran tuksnesī un citos tuksnešos visā pasaulē. Podaxis ir saistīts ar sēnīšu ģimeni Agaricaceae. Sēne atgādina puffball; tas ir kokains un šķiedrains. Podaxis augļu korpuss rodas pēc tuksneša augsnes, smilšainas augsnes un ceļmalas pēc lietus sezonām. Tomēr, ja lietus nenāk, tad augļu korpuss neradīsies. Pūlis (vāciņš) attīstības laikā paliek aizvērts, lai aizsargātu auglīgos audus, žaunas un divsienu sporas no izžūšanas.
Kokcidioīdi
Coccidioides ģints ir augsnes sēnīte, kas sastāv no divām sugām - Coccidioides immitis un Coccidioides posadasii. Abas sugas ir sastopamas tuksnešainā augsnē Ziemeļamerikā un Dienvidamerikā. Katra suga rada hyfae un sporas augsnē. Kad augsni, kurā atrodas sporas, izjauc cilvēki vai notiek dabiski uzbrukumi, piemēram, putekļu vētra, sporas nonāk gaisā. Sporas ieelpošana var izraisīt nelipīgu sēnīšu infekciju, ko sauc par kokcidiodomikozi, vai ielejas drudzi. Retos gadījumos, ja tiek ieelpotas neskaitāmas sporas no abām sugām, tas var būt letāls.
