Sēnītes un aļģes bieži sajauc un savstarpēji apspriež. Sūnains ķērpis, kas bieži sastopams uz klintīm un kokiem, faktiski ir sēnītes un kāda veida aļģu kombinācija; tomēr sēnes un aļģes faktiski ir diezgan atšķirīgas lielākajā daļā aspektu. Piemēram, kamēr aļģes ir protista valstības locekles, sēnes ir augu valstības locekles. Turklāt atšķirībā no daudzām sēnēm aļģēm trūkst jebkāda veida sakņu vai kātu. Neskatoties uz būtiskajām atšķirībām, sēnēm un aļģēm ir dažas līdzības.
Gan aļģēm, gan sēnītēm ir tendence zelt mitrā vai mitrā vidē.Daudzas šķirnes
Aļģēm un sēnītēm ir kopīgs ir tas, ka šie divi termini aptver ļoti dažādas sugas. Piemēram, sēnēs ietilpst ne tikai sēnes un lielākas sēnes, kuras daudzi cilvēki ir pazīstamas, bet arī mikroskopiskas šķirnes, piemēram, raugs. Šīs šķirnes pastāv gandrīz katrā Zemes ekosistēmā.
Līdzīgi aļģes variē arī no mikroskopiskiem organismiem, piemēram, vienšūnu organismiem, līdz pat milzīgām brūnaļģēm, kas var izaugt pat 65 metrus garas. Pēc Smitsona nacionālā dabas vēstures muzeja datiem, ASV aļģu kolekcijā ir gandrīz 300 000 eksemplāru. Tāpat kā sēnītes ir plaši izplatītas ģeogrāfiski, arī aļģu šķirnes var atrast visā pasaulē dažādās vidēs, ieskaitot dažas no ekstrēmākajām vidēm uz zemes.
Mitra vide
Gan sēnītes, gan aļģes dod priekšroku mitrai videi. Faktiski viens no ieguvumiem, ko aļģes gūst no to simbiotiskajām ķērpju attiecībām ar sēnītēm, ir to spēja izdzīvot uz sausas vietas mitrā vidē.
Kaut arī sēnes dod priekšroku mitrai videi, sēnīšu sugas var atrast gandrīz jebkurā vidē, ieskaitot tuksnešus.
Aļģēm izdzīvošanai parasti ir vajadzīgs vairāk mitruma nekā sēnītēm. Patiešām, lielākā daļa aļģu ir atrodamas ūdens vidē, piemēram, ezeros un okeānos, lai arī tās var atrast arī sauszemes vidēs.
Haploīdie kodoli
Gan sēnītes, gan aļģes kopumā ir to organismu piemēri, kuriem ir haploīdi kodoli. Tas nozīmē, ka viņiem ir tikai viens katras hromosomas eksemplārs. Turpretī diploīdiem organismiem, piemēram, cilvēkiem un lielākajai daļai zīdītāju, ir divas katras hromosomas kopijas.
